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1、二氧化碳培养箱的加热方式有两种，水套式和气套式。水是很好的绝热物质，水套式培养箱在开门过程中温度下降速度慢，能很好的保持培养箱的温度，但是缺点就是需要加水，清空水箱和清洗。气套式培养箱是由加热器直接加热，操作比水套式的培养箱简单。但是散热很快，开门时间长温度就会下降很多。现在市场上多为气套式培养箱。
2、一般的细胞培养都要求37度，5%二氧化碳的浓度，这种条件对霉菌生长也是很有效的。保持培养箱无菌至关重要，如果你的培养箱不是在层流实验室里放着的就经常会在铁盘上长菌，清洁起来也很麻烦，尤其是培养箱利用率很高的情况下。现在多数采用往增湿盘中添加饱和硫酸铜的方法处理，这种方法还是比较有效的，但是如果对环境有要求不能放的时候，就要经常换增湿盘的水。我的建议是每两周更换一次。有些培养箱中增加了照射增湿盘的紫外灯管，我觉得毫无用处，时间长还是会长菌。还有些培养箱有过滤器，一般都在培养箱顶端，这种装置比紫外的效果要好，也可以参考使用。尽量在拿取放置培养皿培养瓶的时候用酒精消毒手。
3、二氧化碳浓度对整个培养环境的影响也是很大，一般的浓度检测系统都是红外传导，但是这类产物在使用一段时间后都会产生二氧化碳数值漂移，尽量选用带红外校正的培养箱。如果是老式的，有一种可以在你关闭二氧化碳后也可以显示二氧化碳值的机器，这类培养箱在清洁过后，先不通二氧化碳，恒温恒湿放置一夜后把显示出来的二氧化碳值调整为零，就完成了校准。如果没有显示的机器也需要不通二氧化碳放置4小时以上，因为红外传导的探测器是在37度，大于95%湿度的状态下才能准确的工作，如果操作不当会引起二氧化碳浓度发生偏移。也可以请专业人士定期对二氧化碳培养箱进行校准，只是有收费，好像500一次还是一台来着，前两年的价格。
4、良好的使用与维护习惯才是设备控制的关键所在，才是培养效果满意的关键所在。